mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGTTCGTAGTTTCACC CCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAGTTAACTTTATTTCTCCGTTGTTTATCCATGACAATGGAAAAGGGATAAGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACCCGTTGACT GAGACCGACTACACGATAAAACCCTAGCTGCATAAAATAAATTGATATTTTTTCCATAAGTTCTCTCTCTTTTTCTAGATCTGATATGATGAAGTGTATGGTGCACCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAGTTAACTTTATTTCTCCGTTGTTTATCCATGACAATGGAAAAGGGATAAGTGTCGATTAGATCATGTTCGTAGTTTCACCCGTTGACTGTCGCATCCTTAAACCCTAATTTTCATCTTTAATTCCATCTGAAATTTCACAGTAGATTTTCTATCTTTTGGTGTTTGAATTTTAAAAGACCTATGTTTCTCTTTTTATCTGATTTGGGAGATTAGTCCACTTTTCTGTATGTGTGTGTATTTGCGCATAGGGATCCAAGGTTTAAAAAAAAATGTTAGGGTTTAATTGCTTGCGTTATTCTATAGAAAACTCTAAATCGTCCAAATTATAGCAAATTGAGATGAAGAACTCTATTTACTTGGAATCTCAGAGAGTACTCTCCCAACTTCTTTTCACAATTATCTTTTAAGAAAATTTCTGGTTTGTTTATTTTATTAGTTTGGCTAGGGCTTCTGAGGAAGTTGAAAGAACACGATTTATGCATATCTCTTCGAGAATCTATATATATATATATAATTAGAGATTTATGAAGTTATTCTCTT 1 0 5' arm Brassica_napus mirnest MIR167_1 1e-62 bra-MIR167a 8e-64 -41.6 .(((...))).(((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))))))...)))))))).)).)))))))))))))).))))))))).......... (-41.6)