mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTCAGGGGCAGCTGT AGAGTGTTCAAGGACAGCAAGAAAAATGAGGGACTTTCAGGGGCAGCTGTGTTTTCTGACTCAGTCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGTTCTTGCAGTGTGCATCGGG 5 1 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-365 4e-41 cfa-mir-365-2 2e-58 -40.1 ...........(.((((((((((.((((((((..(((.(((((((((((.(((....))).)))).....))))))))))..)))))))).)))))))..))).)...... (-40.10)