mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCATAGAGGAAAATCCATGTT CGTGGATATTCCTTCTATGTTTA CAGTCCTTCTTTGGTATTTAAAACGTGGATATTCCTTCTATGTTTACGTGATTCCTGGTTAATCATAGAGGAAAATCCATGTTTTCAGTATCAAATGCTG 3 1 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-154 1e-31 mml-mir-376b 5e-52 -34 ((((.....(((((((((.(((((((((((.(((((.(((((......((((.....))))..)))))))))).))))))))))).))))))))).)))) (-34.00)