mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATGCTTCTGTCATCA GGGATTGGGGACTTGGGGAGAGGGAGAGGAGGCACTGCTGATGCTGTTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATGTGCAATTTTTGGATTCTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTTAGCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTTAGG ACTTCTCTGCCTCTATATTTTATCTCCCAAATTGCTTCCCTTCCTTTTAAAGAAACTATCCCTTGTGAACATTTTCTGTCCGAAGAGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAATGAAGCTCTCCTTTGTAATCCTATTCTAGTTATCAAATCAAAAGGCTCAAAAAGCTATGCTGAGATTAATTTAAAATAAAAATACCATTTGGAGAATAGGGGATTGGGGACTTGGGGAGAGGGAGAGGAGGCACTGCTGATGCTGTTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATGTGCAATTTTTGGATTCTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTTAGCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTTAGGCTTTTTCTTCATTAAAAGTATCTGACAAGTACTCATAATTAAAGAGAGTTGACATGATGATGCTGCTTTTGAGTCCGGTAATTTGCAGTTGGAGTGCTGAAAGCAGCACGAGTGTTTGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC 1 1 5' arm Bruguiera_gymnorhiza mirnest 100 rco-MIR156h 8e-31 -73.8 ((((..(((((....(((((((((((((((((....(((((...((..(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((............))))).))).)).)))))))))))))).))))))))).))...)))))...)))))))))))))))))))))).))))...... (-73.8)