mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGACATCACATATACGGCAGC GGTCGTATGTGTGACGCCATTT GTGGCAGCTTGGTGGTCGTATGTGTGACGCCATTTACTTGAACCTTTAGGAGTGACATCACATATACGGCAGCTAAACTGCTAC 3 0 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-489 2e-29 ptr-mir-489 6e-42 -38.4 (((((((.(((((.(((((((((((((.(.((((..(((((....))))))))).).))))))))))))).))))).))))))) (-38.40)