mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACCTGGAGGACTCCATGCTG CCATGGATCTCCAGGTGGGT TGGAGGCCTTGCTGGTTTGGAAAGTTCATTGTTCGACACCATGGATCTCCAGGTGGGTCAAGTTTAGAGATGCACCAACCTGGAGGACTCCATGCTGTTGAGCTGTTCACAAGCAGCGGACACTTCCA 2 2 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-490 3e-48 mml-mir-490 1e-68 -54.4 .(((((..((((((.(((((((........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))..))).))))))))))...))))). (-54.40)