mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTATTACATGGCCAATCTC GGTTGTCCATGGTGTGTTCATT CCCAAGTCAGGTACTCGAATGGAGGTTGTCCATGGTGTGTTCATTTTATTTATGATGAGTATTACATGGCCAATCTCCTTTCGGTACTCAATTCTTCTTGGG 3 0 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-154 2e-33 ptr-mir-496 1e-52 -43.1 ((((((...(((((.((((.((((((((.(((((..(((((((((........)))))))))..))))).)))))))).)))))))))........)))))) (-43.10)