mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATCACAGCAAGTCTGTGCT TTAAGACTTGCAGTGATGTTTA GCCCTGTCCCCTGTGCCTTGGGCGGGCGGCTGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTAACTCCTCTCCACGTGAACATCACAGCAAGTCTGTGCTGCTTCCCGTCCCTACGCTGCCTGGGCAGGGT 4 0 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-499 6e-37 hsa-mir-499 5e-65 -62.32 (((((((((.....((...(((((((.(((.((..((((((((.((((((((((.............)))))))))).))))))))..)).))).)))).)))...)).....))))))))) (-62.32)