mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGCATGCATGCATGCTATT CAGAACTGCATAGCATGCCATGG AGAGGCGGGATATTGCATGCATGCATGCTATTAATTTATACAGGACAGAACTGCATAGCATGCCATGGGGATATTT TTCGAAAACTAGGCGCGAAGCTTTTGATCCCATGGAGAATCAGAGGCGGGATATTGCATGCATGCATGCTATTAATTTATACAGGACAGAACTGCATAGCATGCCATGGGGATATTTGCATGGCATGCAGAGAAATGCCCGGGATGCATGCAATGCATGCCATGCATGATTTTTTTTTTT 4 2 5' arm Carica_papaya mirnest 100 100 -15.7 ..........(((.(((((((((((..((.((...........)).))...))))).)))))).)))......... (-15.7)