mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTTTGGCTCGAGGT TTCTGAGAGGTGGAGGTTAATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATCTGTGATAACCTCTGAAATTTTCTTAGGGGCCTTTTTACTTTCCCGGAAAATTTCTGCATCTACATACCTCTAGTTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAACCGAACACTTCTTTC GCGCGGCAAAGGCCGGGTTATTCGGCCATTACGGCCGGGGATTTTTCAGGTCCAAAAGCAAGAGCTGCGTTTTCTGTATTTTCAATCACCAGATACCTCAAATCTCTTCTGGGTAATTTTTTTTGGGTTATATCGTATATGGGTTTTCATCCGTTTTAGGGTTTGTTACGGGTTCATGGCCGGCCGACGATCAGTTGTTTCTGAGAGGTGGAGGTTAATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCATCTGTGATAACCTCTGAAATTTTCTTAGGGGCCTTTTTACTTTCCCGGAAAATTTCTGCATCTACATACCTCTAGTTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTCAACCGAACACTTCTTTCTCCCGGACGCAGATGGTTCATTTTCATGGTAGAGGTAATCTAATCTTTTTTTCTTTCTATCTCCGATTTTCCCTAGAAAGCTGAGTTCTGAAGTAGTTTGCATGGAATCAAATTAACCCACCTGTCAAAGATGCTAACTAACATAGCAGAAGATGCCATTGACCTACCAGCTTTGACCATGTCCTTTACCTTTCATCTTCTCTCAAAGATGAAACGCTCTCTCTCTCTCTCTCACAC 3 0 3' arm Carica_papaya mirnest mir-166 9e-71 csi-MIR166b 0.000000000002 -60.2 ....((((((((..((((.(((((((((..((((((.(((((((((.(((...........((((((((((..((((...........))))))))))))))................))).))))))))).))))))..))))))))).))))...)))))))).. (-60.2)