mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAACGAGAGAGAGCACGC GTGCTCTATGTCGTTGTCATA TGGGATTTGGGTGACAACGAGAGAGAGCACGCTTGTTATCACTCATCCGAGGTATATGATTGTGTACGGGCGTGCTCTATGTCGTTGTCATACAATCTGT CGGAATGGCCCCCGGATTCGGCCATTACGGCCGGGGATTTTTTTTGTTCCGTTTATTCCTAATTTTCTGGGTAGTGAAGCCGTAAAACGGGCAAATGCCTGGAAGATTCTCAGTGGATCAGCACCTTCTCATCTTCTCATTTGGCCTTTTTTTATCCACAACCACAAGGGTTTTCTTCATGCTCCTATATAATTTGGGATTTGGGTGACAACGAGAGAGAGCACGCTTGTTATCACTCATCCGAGGTATATGATTGTGTACGGGCGTGCTCTATGTCGTTGTCATACAATCTGTTCAGGTGGAGGGTTTGCTTTCCTCTTTGCATTTTTTGCCCATGGGCTCCTTGCTGGTGATTCTACACCTTCAATGCATTTGTACTTCATATTCTGATTTATGCACCTTGTTGGTGAATATGATTACATCTTAAGATATGTTTGTAACAAATTTAGAAATTTTGTGCAATTTCTTTTGCAAATACACACTTAACTGAACTATGAGAGGATACAAATCTTATTTAAAGATGATATAAGTTGAACTCTTATGGAATTTCATGTACTTGATGAAATTTGGAATTCATTGTTCCAATTGCATATTGAATTTTGTACGAGGTTAACAAACACCCCGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGGTAAGTGAACATGGTCATAGCTGTTTCCTAGGAGATCCTGGTCATGACTAGTGCTTGGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGGAGTTCTGGGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGGAGTCCGAAGCGAGCTCGATGTCAAATTACGCCCCCGCCCTGCCACTCATCGCAGTACTGTTGTAATTCATTAAGCAATCTGCCGACATGGAAGCCCATCCACAAACGGCATGATGAACCTGAATCCGCCAGCGGCCATCAGCACCTTGTCGCCTGCGTATAATATTTGCCCATGGTGAAAACGGGGCGAAAAAGTTGTCCTTATTGGCCCACGTTTAAATCAAAACTGGGTGAAACTCACCCAGGGGAATGGGCTGGAAACG 3 0 5' arm Carica_papaya mirnest MIR535 4e-50 vvi-MIR535c 0.000000000000001 -42.9 ..(((((...((((((((((...(((((((((((((...(((((((.........))))..))).)))))))))))))...))))))))))..))))).. (-42.9)