mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCATGA GTAGTGGAGATGGGATGACT TGTCGAGGTTTAGTAGTGGAGATGGGATGACTCTTGATTTCTTGGGGATTGGCGGGTCAAGAAACAGCGGTAGGATCAATAATAGTAGTGATAATAATAATAATATTCTGCATGATCATCAAGAACATCAAGAATTGATAATTGAGTTTGGATCAGGAGGAATCAATGGCGGTCATCATCATCATCATCATGAGACAAGAAT CCGGGCAATGACCGGGAGTCGGCCATTACGGCCGGGGGGGATCTGCAGTTATCTGGTTCTGCCTCGATGTCTGCCACGGCATTGTTGCAGAAAGCAGCGCAAATGGGTGCAACTTCTAGTGGTAATACCACTGTAATGAATAGTAATACTGGGAGCTGCATGGACTCGCCATTGATGATGCAGAAGAGCTTTGTGATGACAACAATGGCGGCTCCACCTTCCTTTGGCTGCACACAGAATAATCATCAATCCCAGACTTTAATGGCGATGAACCAGACGTTCAACAGTAATAGCAACAACATGGGGATGTTCAACGGAGTTTTTGACGACCAAAACGACAACAAAAGTAGCGTTTTGTCGAGGTTTAGTAGTGGAGATGGGATGACTCTTGATTTCTTGGGGATTGGCGGGTCAAGAAACAGCGGTAGGATCAATAATAGTAGTGATAATAATAATAATATTCTGCATGATCATCAAGAACATCAAGAATTGATAATTGAGTTTGGATCAGGAGGAATCAATGGCGGTCATCATCATCATCATCATGAGACAAGAATTCAAAGTTTGAACCCTTTTCAACAGCATGCAGCTGCATCAATGGAGAAACCCATGTGGGAGGTATAAAAAAACACCTTCTCTTCTCTCTGCAGCATCAATGGAGAAACCCTAGCAAGCTCTAGCCTCTTCAGCTACCTACTGGTTAATTAATTTTTTTCCCTTTCTCCTCTGCAGGTTCTAGCTAGTCCTTGCGTAATATATGAATTCGTTAATTAGTTACCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTCAAAAAAATGTTTATATATATATATATGTTATAAGCAGCACCGTGGAAGTAAGAACATGTAAGTTTACTGTGTCCTGCTAAAGAGCAAGGCTTCGAGAAATTTTAGCCAGGATTTAGAAATTTATTATATTAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCCGCCTCGGCCCTCGAGAAGCTTTCTAGACCCATTCGTTTGGCGCGCGGGCCCAGTAGTAAGTGACATGGATCATAGCTGTTTCCTAGAGATCTGTTCATGACTAGTGCTGATCTCACCAATAAAACGCCCGGCGCACCGAGCGTTCTGAACAATCCAGAATGAA 3 1 3' arm Carica_papaya mirnest mir-598 0.00005 100 -47.8 ..((...((((.((.((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((((..............((..((((.((....)).))))..))..........))))).))))).))))))).)))))).((((((..((((.......)))).....))))))...))))))).))))).)))).)).))))..)).. (-47.8)