mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAACTGTAATTACTTTT ACATAATTGCAGTTTTTAT TAATAACTATTAGGTTGGTGCGAACATAATTGCAGTTTTTATCATTACTTTTAATGGCAAAAACTGTAATTACTTTTGCACCAACCTAATATTTTAGT 2 0 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-548 2e-18 hsa-mir-548aj-2 9e-23 -46.1 .......(((((((((((((((((..((((((((((((((..(((((....)))))..))))))))))))))..)))))))))))))))))....... (-46.10)