mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTTCCCTTCGGGGCCTT CACCGCACGTCGCGTGGTGTCCGGTGCGCTCCCGGCGGCCCTTGAAAATCCGGAGGACCGAATGCCGTCCACGCCCGGTCGTACTCATAACCGCATCAGGTCTCCAAGGTGAACAGCCTCTGGTCGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTTCCCTTCGGGGCCTTCCCCGCGCGTCGAACAGCCAACTCAGAAATGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCAACGGATGTTCACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATG 5 1 3' arm Capsicum_annuum mirnest 100 peu-MIR2911 1e-41 -71.2 ((((((((..((((.((....(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....))))))))).))))))))))))))..... (-71.2)