mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGTCAGCGGTTCATCGAT CGATAAACCTCTGCATCCAGT TTGTGCGTTTGGTGGAGTTCATTGGAGTCAGCGGTTCATCGATCAGTTCCTCTAACAAACATACGAACAAGGGGGAGAAAGAGAGAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTCCACCCCTGCCGTGCCT AGAGAAGACGAAGAGCGATCAAACGTACGTTAATGGCGGACCACAATCCTTCTGGTTCGTCCATTTCTTCTCTACACAATTAACTGTTATTTTATAGCTTTATAGCGATTCACGATGACCATATATATATATATACACGTATCTGCAGTTCTGTACGTATATTTTATACGTCAAGAGTTGCAGATCTGAATTTTTCTGAGATCGTTTGGATGAAATCTTCGTTATTTGTTGATTGATTATGGTTTGAATTTGTGCGTTTGGTGGAGTTCATTGGAGTCAGCGGTTCATCGATCAGTTCCTCTAACAAACATACGAACAAGGGGGAGAAAGAGAGAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTCCACCCCTGCCGTGCCTTTCCCCAAGTCTGGTCAAAAAACTGTGGTTGGGCTCTAGGTCCATCGAAAGCTGGGCTGGGATAGTGGGGATGCCTGATACCGCTGGGGAGGCGTGTGTGCATGTGTTTGTGTTCATGGTAAGTCGTTCATTGGTTCGATGCTGCCATGCCTTCCGAAATAAAATAATCGTTTTTTTGTTTCTAATTGATGATTGTTTCATTGATTTCGTTCTTGTTTTTGTTTCCTACTTAATGAATTTTACAAAAACTGGTTCTTGTTTTTTTTTTCCTAAATGAATCTCGTGAACTTTAGGAAGAAATTTGTAGATTGTGACAGATTTGAAGGTAGAATATTTGATTAAATTTGTTATATAATGATTCTATATTCATTTTGAAGATATTCGATTG 4 0 5' arm Carthamus_tinctorius mirnest MIR162_2 0.000000008 osa-MIR162a 0.0000000004 -47 ..(((((...((((((...(((((((..(((.((((.(((((((.((((((((..............................)))))))).))))))).)))).)))..))))))))))))).....))))).. (-47)