mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTCACTGTTCTTCCCTAG AGGGAAGGGTCCAGGGTCAGC GCGTTGGCTGGCAGAGGAAGGGAAGGGTCCAGGGTCAGCTGAGCATGCCCTCAGGTTGCTCACTGTTCTTCCCTAGAATGTCAGGTGATGT 8 0 3' arm Homo_sapiens mirbase mir-1178 2e-39 ppy-mir-1178 1e-40 -37.8 ((((((.((((((.....(((((((..(...((((.(.(((((......))))).).))))...)..)))))))....)))))).)))))) (-37.80)