mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTACAGAATTTTGACTT GTCAAACTTCTCTAGCTTTGA ATGCTGGTCGTTTGGTTTCTTTTTCTTTAAGTCAAACTTCTCTAGCTTTGACCAAGTTTATAGAAAGTGCGCCAAAATCGACAGCATCAAATTGGTTTAATTAAATCCATCTTAATATATCTTGACAGTACATTTATTTGGATTATAGATGTTAATATTTTTCAATAAACTTGGTCAAAGTTACAGAATTTTGACTTAGGACAAAACTAAATGACCTAAATTTG CTGGCCATCTTGTAGTCAGTTGGCATGCTGACATCAGAATCTACTGAGGTCTAACCAGATTGCTAGCCAATTTCTGTTTCCATGCTGGTAGCTGTGCTTGAAACCATATTTAAGTTATTGGTATGTAATATGGGTATCAAGTGAATTGCAGCAAAGATGTGCTTATTGGTCATAAAGTATTGCATCCCTTTCAAAATGCTGGTCGTTTGGTTTCTTTTTCTTTAAGTCAAACTTCTCTAGCTTTGACCAAGTTTATAGAAAGTGCGCCAAAATCGACAGCATCAAATTGGTTTAATTAAATCCATCTTAATATATCTTGACAGTACATTTATTTGGATTATAGATGTTAATATTTTTCAATAAACTTGGTCAAAGTTACAGAATTTTGACTTAGGACAAAACTAAATGACCTAAATTTGGAACGGAATGAGTATATTGTTGCTATGTTTAGAACCTTACATTAACAACAGGACAGCTAAAATATAACCCATGTGCTCAAGAATAGATGTATCATCACTGGTTCACCATTATCCTATAAATGTATGAATTCTGTTCTTTTTTGCACTTACTGTATTAGCTACTATCTTTCCCATTTCCAACGATCTTTAGTTAGAAGGTTATAAGCTTCTGATATAATCAACTTGTGACTGTTGCAGAGTTCACCAGCTTATAGCTGGCTAGGAGGTTCCCAAGGCAGCTCCTCTGGACTGATTGTCAAGAAAACAATGAAGGTTGATATCCCT 2 0 3' arm Cenchrus_ciliaris mirnest 100 osa-MIR437 1e-17 -64.6 .....(((((((((((((...(.((((.((((((((.((((.(((((((((((((((((((.(((((.(.(((((................))))).).(((((...(((((......((((.((.((.....)).)).))))...))))))))))..))))).))))))))))))))))))).)))).)))))))))))).))))))))))))))........ (-64.6)