mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCATGAGGTCATGGGTTCAAG TGAACTTGAGACTTCACCTTT ATAAAGACATAAGTTTTCTTTGGTTTAGTTGGTTAGTTAATTGCCTTATAACCATGAGGTCATGGGTTCAAGTCTTATTAGAGACATTTTTTTAAGATTTTGATTTCAAATTTAGTGTTATAAAAAAATTTGTTTGTACCAAGAATTGAACTTGAGACTTCACCTTTGAAAAGCAATGAACCAACCACTAGACCAATAGAGATTTTGTGTAAATT CGTCGTAGTGTAAAAAAATACGGTTCCACCGTATCAATTTATCGTGTGCCACCATATATGTTGTAACTGCAATAAAGACATAAGTTTTCTTTGGTTTAGTTGGTTAGTTAATTGCCTTATAACCATGAGGTCATGGGTTCAAGTCTTATTAGAGACATTTTTTTAAGATTTTGATTTCAAATTTAGTGTTATAAAAAAATTTGTTTGTACCAAGAATTGAACTTGAGACTTCACCTTTGAAAAGCAATGAACCAACCACTAGACCAATAGAGATTTTGTGTAAATTGTCTTTATATATGTTTTTTATAGTTAAATGGTGCCACCGTTGGAAAAAAGTTCTAAATCCGTCCCTGAATGAAGACTCAAATTTTCATTGTGAAAATGAAGATACTCGGAGCGTGTCAGATTTCTATTAAGCTCATATTGAGTTTGAATGATACTGGATTATTCATACCAAATATTATGCATAATATTCACATTGAATAATACAACATTTTGTATTATTCAGTTTGGGTAGTGTATATTGTTCGCCTTGAATAATACATAATATTTGGTCCGAATAATCTTGTATTATTCAGATTGAACATGACATGTGGTGTGCTTTCTATAGATATTACATTTTTTAACCAATTAAGTGTAAATTCACTAGATCAATTTCTTTTTGAAGTGAAATTTATTTGTGAACATGAGATTAAAAATGGTCACTTACTTTGATACAAATTAAAATAGAAATATAGACATTTATTTTAAGGATTAAGGAGA 5 0 5' arm Centaurea_maculosa mirnest 100 100 -63.3 ......(((((((.(((((((((((((((.((((.(((.(((((.((.(((...(((((((.(((((((((.((((..((.(((((((((((((.(((.((((........)))).))).))))))))..))))).))..)))).))))))))).)))))))...))).)).))))).))).)))))))))))))).))))).)))))))..... (-63.3)