mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAGCCGAGCTTGAGCTCGT GAGCTCGAGCTTTGTTATTTA GAGCTTGATTTTGCTTTTAGACGAGCTCGAGCTTTGTTATTTAACGAGCCGAGCTTGAGCTCGTTTAGGCTTGTCGAACACTC CGGATTACCCGGGATGTAGGCTATTCAGCTATTGTACCTGTATTTGTTTGTGGTTTTATTTTTTTTGGAAATACAAGAGCTCTTTAACGAGCTTGATTTTGCTTTTAGACGAGCTCGAGCTTTGTTATTTAACGAGCCGAGCTTGAGCTCGTTTAGGCTTGTCGAACACTCGAGTAATAACGAGCCGATCCCGAGCTCTTATACATGCAGAACGAGCCGAGCTCGAGCTAAAAAATACATGTTCGAGCGAGCTCGAGCTCGAGCTCGAGCTTCTATAACCTTAAGAGAGCCTGGCTCGATAAGTATGAAGCTCGACTCGGCTCGGCTCGATAGTAACTTACTAATACATGGGGAACATAATAACAATTCTAATCCTTTTTATTAACACACACCTGATTATAAACTTATAAGGGCATTATAGGCGTTTTTCAATTATGTATCCCATTAGAATCCAATTGAAGACCTGCATCCCTTTCTTACTTCAAAGCCACCTCTCTTTCCTCTCCTCCACCCCCTTCCCGCCGGAGCTCCACTGCCCTCTTCCGCCGGAGCTCCACCGCCCCTTCCCGCTGGAGCTCCACAACCCCTTCCGTCGTCGTCGGCGGCGCCTACTCCCCTCCGGCGACTGTCGGCGTTACTTCTCCTTCGAATCTCTTTCTGACTGTCGGCAAGAATCCATCATTCCGGAAATTAAATCCCGGCGACCACCACCACCGCGAACCTCACCATCTTCCAGATCTATCATCACCGCCACCACGTCTACCACCGCCGCTGCAAATTCCGACGACCTCACATCGTCACGACTTCTAGATCTGTCACCACTCACACGTCAGATCTGCAAATTCAGGGACTTACCGCGGTCACGACTCACACGCACACACGTCTTCACCACCCACCGCGTCTGTTCACAAACGCGCCGGGGCGACGT 4 0 3' arm Centaurea_maculosa mirnest 100 100 -34.6 (((.(((((...(((..(((((((((((((((((.(((........))).))))))))))))))))))))..)))))...))) (-34.6)