mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCAAGCATA GTGTAAGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTTCAGAGCCCATCGGTATTTCCAATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCACAT CTTGATTTGGTGGAACTTATGTGGAACCAACCCCAGAGCGCTTGTTTCTTTCTAACGTTCGGCACATGTTTCAGCTTATAAACACACTCTTTTTTTGTTGTATATAGGTCTCCCACAATCTTTCTGCATCTTTTGAAGCCCTTCTTGGTGAATATATCATCTAAAGTTTTAATCTTGATTTGATCTTTGAAATCTTGGTTCAAGAAGTCATATACACATGCCACTCTCTATGGATTCATCTTCTTGGATGTTAAATCATATGCTTTCAAGGTTCATTTTTTGAGGTAAAATACATTTAAATACTCGTAGATACATACACGATGAGTGTAAGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTTCAGAGCCCATCGGTATTTCCAATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCACATCTTGTACGTTCTACAACTTTACTTTTTTTCTTACATTGTCTATATCTATGAAGGCCATATTAGTCAATTTCACATCTAATTTAATTAGTCTTCTACGAGTCTCACAATTAAAAGGGACTTTGCGATTAATTAACTATGGTATATGTATAGTTTTATGTGAAATTTTTGTAGAGGTTGAAGGGTAGCATTGTAAATTTATTAAAGATGCATGCCCAGTTAAATCTTTGCTCCCAAGGGGGAATATTGGAACCCCCAGGTAGAATTTCTTCAACTTTCTTGATCATCTTCGGCACCCATTTTTCATTTTAAGGGGGTCTTTGTTAC 2 0 5' arm Centaurea_maculosa mirnest mir-160 1.0E-19 ptc-MIR160c 2.0E-24 -43.8 (((.....((((((.(((((((.((((((((((((...(((.((((.((.....)).)))).)))...)))))))))))).))))))).))))))..))).. (-43.8)