mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGTCAGCGGTTCATCGAT CGATAAACCTCTGCATCCAGT TTGTGCGTTTGGTGGAGTTCATTGGAGTCAGCGGTTCATCGATCAGTTCCTTTAACGAGCATATGAACAAGAGAGAGTGTAAAAGAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTCCACCCCTACCTGCCTT AAACGCAGGGCGATCAAACGTACGTTAATGGCGGACTACAATACCTTCTGGTAATTCGTCCATTTCTTCTCTACACAATTAACTATCATTTTATTATAGCTTTATAGCGATTCACGATCAACCGATATATATATATATATATACACACACAGTTCTGTACGTATATCTTATACATCAAAAAAGAGTTGCAGATCTGAATTTTTCTAAGCTTAATCTCCAATATGTTATCTGTTTATCTGTTTTTTGATTCGTTTCGATAAAATCTTCGTTATTCGTTGATTGAAATCGTGTGTAATTTGTGCGTTTGGTGGAGTTCATTGGAGTCAGCGGTTCATCGATCAGTTCCTTTAACGAGCATATGAACAAGAGAGAGTGTAAAAGAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTCCACCCCTACCTGCCTTATTTTATCATCATTAATCTGTAGGTAATAATCGTTTTTTGCCTTATTTATCATCATTAGCTAATGATTTTACAGAAACTGGTTTTGTTTTTGTTTTTTCTAAATGAATTTTTCTGAACTTTGGAAGAAATTTGTAGATTGTGACAAATTTGAAGGTGGAATATTTGATTAAGTTTGTTGT 4 0 5' arm Centaurea_maculosa mirnest MIR162_2 8.0E-9 osa-MIR162a 4.0E-10 -43.8 ..(((.((..((((((...(((((((..(((.((((.(((((((.((((((((.....((((..............))))...)))))))).))))))).)))).)))..)))))))))))))...)).)))... (-43.8)