mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCATCA ATGGTGGTGATGGTGGTAATG GGCAACGACAAGATGATGGTGGTGATGGTGGTAATGATAATGAGATGGAGAACGGTTTTGGTGGAAACGTGGTGGTTCCGGAGAGCTTTGAAGAGCAGATGATGCTAGCCATGGCGGTTTCACTGGCTGAGGCTCGAGCTAGGACGAGTACACCGGAGGTTGCGTGGATTTAGCGTGCGTGTGTGGGTTGTGTTTTATACGGTATGTAAAACAGGAAAGATATAAAAGTGTAGATGGATGATGATGTTTCTTTGAATCAATGGACAGACAGACATATAGGGATTTCAGGGTCTGTATGATTGTTTGTTGTTGATGGGGAGATTTGGGTTTGAAAATTGCAAGTTAATCATCATCATCATCATCATCATCTTTTGCCAAA GGCAAGCACCAAAACCGTAACCCTAACTACGGGGATGCCGCCCAATTAGCAAAATACGCGACAGAAGTTCGTGTTTTGGCATCCATGGCCCCACAGGCGGCCGCAGAGTCGTCGTCGTCTTCCACGTCATCACCTTCCGGCGGTCTTGCATGCGCTATAGCCGCCCTTGCGGAACGGCAGCAAATGGGCGGAGAATCCTCCGCCAATTACAACAATTACGGTGGGAACGTATCGACGTATAACGTCCAGCATCCAACGGGGTTATCACTTGATAACCACCATCTGGGAATAAGATCGGAAGGGGGGTGGGTTCAAGATTCTTCAAATGCATACGGAGGGTATGATGGTAATTCAAACGCGATAGAGGATGATAACGATGGAAACAGATACGGGCAACGACAAGATGATGGTGGTGATGGTGGTAATGATAATGAGATGGAGAACGGTTTTGGTGGAAACGTGGTGGTTCCGGAGAGCTTTGAAGAGCAGATGATGCTAGCCATGGCGGTTTCACTGGCTGAGGCTCGAGCTAGGACGAGTACACCGGAGGTTGCGTGGATTTAGCGTGCGTGTGTGGGTTGTGTTTTATACGGTATGTAAAACAGGAAAGATATAAAAGTGTAGATGGATGATGATGTTTCTTTGAATCAATGGACAGACAGACATATAGGGATTTCAGGGTCTGTATGATTGTTTGTTGTTGATGGGGAGATTTGGGTTTGAAAATTGCAAGTTAATCATCATCATCATCATCATCATCTTTTGCCAAAAA 2 0 3' arm Centaurea_maculosa mirnest mir-598 0.00009 100 -100.3 (((((....(((((((((((((((((((((((.(((...(((...((((..(((.((((((((...((......((((.((.(((((((....((((.....))))((((((((.....))).))))))))))))...)).))))..)).))))))))....)))...)))).))).))).((((..((.(((((((((.....))))))))).))....))))((..(((((......(((..((..(((((..(((((((.((((((((.((((((((..........)))))))).)))))))))))))))..)))))..)).)))......)))))..))....))))))))))))))))))))))))))))... (-100.3)