mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTCTTCATCATCATCATCT TGATGATGATGATGATGAGACCA TCTTCTTCTCCATTTCTTCATCATCATCATCTCTTCATCCCAAAACCATCTTATGACTTCTAAACGACAGCCTCAGGCATTGCCGAAATTCGGCGAATGGGACGTAAAAAATCCGTCCTCTGCCGATGGATTCACGGTCATATTCGCAAAGGCACGGGATGACAAGAAAACCAACGAAACCGTCACCGTTCCACCTCAAAAAAGCAACAGCACCAACAAACCCCCTCTTCCACCACAACACCAACAGCAGCAGAATCGGAAATACGAAGAGGAATCAAAGAACTCTAGGTTTTGTTGTTTTTGATGATGATGATGATTTGAGGATCCATTGTCAACAAATTGATGAACATGTGTGGTTCTTGATCAGAACTTTAAAATGGATGGTGGCTGGTTTGATTTGATTGATGATGATGATGATGAGACCAAGGTTAGG AAAAGAAGTGGTATTATGTGTATGAGGTTATGGTTACTTTGCATGGATTGTCCCTGAAGGAAGGCATGCCCTGGTTTGTTGAAGGGAACTCCTCCTCCTCCTATGCCTATGCCTTCTTTCTTCTTCTCCATTTCTTCATCATCATCATCTCTTCATCCCAAAACCATCTTATGACTTCTAAACGACAGCCTCAGGCATTGCCGAAATTCGGCGAATGGGACGTAAAAAATCCGTCCTCTGCCGATGGATTCACGGTCATATTCGCAAAGGCACGGGATGACAAGAAAACCAACGAAACCGTCACCGTTCCACCTCAAAAAAGCAACAGCACCAACAAACCCCCTCTTCCACCACAACACCAACAGCAGCAGAATCGGAAATACGAAGAGGAATCAAAGAACTCTAGGTTTTGTTGTTTTTGATGATGATGATGATTTGAGGATCCATTGTCAACAAATTGATGAACATGTGTGGTTCTTGATCAGAACTTTAAAATGGATGGTGGCTGGTTTGATTTGATTGATGATGATGATGATGAGACCAAGGTTAGGGTATGTCAATTAGCTTTTACCATTCACTGTGAATCCAACAACAACTGCAAGGATATCTTGCTTTATAATCATCTAAATTTGATTAGTGAGTTTTATAGGGGTAATTAGATAGAGATGTATGTGTTGTTTACTTATTATTGGAAGATTATAAAAGATTTCTTCATAGTTTATCAAAAAAAAAAAAAAAG 2 2 5' arm Centaurea_maculosa mirnest 100 100 -106.3 (((...(((...((((.((((((((((((((((.(((..(((..(((((((...((.((((...(((.((((.(((((((((((((...)))))))..((((((.........)))))).))))..(((((((..((((((..(((....((.((((...(((..................))).)))).))...(((.(((((((((((.(((.........(((((((..((.......................))......)))))))...............))).)))))))))))..))))))..))))))...)))))))(((((((....)))))))...))...)))).)))...)))).))......)))))))...)))..)))...))..)))))))))))))).))))...)))..))) (-106.3)