mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGTGTTTCCCCCACGCTTT AGCGCCTGTCTAGTAAACAGGAG TTGGTTAAAGCGCCTGTCTAGTAAACAGGAGATCCTGGGTTCGAATCCCAGCGGTGCCTCCGTGTTTCCCCCACGCTTTTGCCAA 3 5 3' arm Homo_sapiens mirbase tRNA 3e-19 mmu-mir-5100 0.00002 -28.8 .((((.((((((..((....(.(((((((((((((((((.......))))).)))..)))).))))).)..)))))))).)))). (-28.80)