mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGATGAGGAGTTGGAACTTG AGTCTTACTTCTGCTGCTT GTGATTATGGTGGTGATTATGGTGATGAGGAGTTGGAACTTGGATTAGGGTTGAGTCTTACTTCTGCTGCTTATGCTCCCACCTCTAATG TGGTGATTTGGTGGTGATGGTGGTGATTATGGTGGTGATTATGGTGATGAGGAGTTGGAACTTGGATTAGGGTTGAGTCTTACTTCTGCTGCTTATGCTCCCACCTCTAATGGTCCTCTCAGTCAGGTGGTGGGATGGCCACCAGTGAAGACTTATAGGATGAACAGTTTAGTCAACCAAGCAAAGTTTTCCAAAAATGAAGAAAAAGAAGTGGGTGGAAATGATGGGTCCAAGAAGAAGAAAAAGAATTCAAACAAAAATGATGAGAAAATGGTTAAAGAAACAGGGCATTCTGGGTTTGTGAAAGTGAATATGGATGGATTACCTATTGGAAGAAAGGTTGATTTAAATGCACATGATTGCTATGAAACTTTGGCTCAAGCTCTTGAAACTATGTTCTTGAAAGCATCCTCTATCCGTAGAGAAAAGAAGCAACATTCTTGGCTTTTGGATGGATCTTCTGAGTTTGTGCTAACTTATGAAGATAAAGAAGGAGATTGGATGCTTGTTGGTGATGTTCCATGGAGGATGTTTCTGGGCACTGTGAAAAGACTAAGAATCATGAAAACCTCAGATGCTAATGGACTTGCTCCAAGATACCAAGAAAAGAATCAGAAAGCGAAGAGCAAGCAAATCGAGTTAAGAAGATGAAGTAACAACCAAAGAATCACCTACAGACTTAGAAAAGTTGAAGCTTTTGTTTGGATAATCATGGCTGCTTTACTATATGTTCACTTTTTTTTTTGGTTTTTTTGCCTTCACCAACGGTTATTTTTTGTCCATTCGATTC 3 2 5' arm Centaurea_solstitialis mirnest 100 100 -21.7 ...((((.(((((.((.(((((((...((((((.(((.(((((.......)))))))).))))))..))).)))).)))))))..)))). (-21.7)