mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG TGTGAGGTGTTGTGGTTGAAACCAGTGGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAAGATAGTGCTGCTGGCTTATGGATTCCTCAAGTCCTATCTTTATGGTTTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATAACCCAGGAGCTTTATTACCTTACTTTATGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCCTCTATTATTTCTATCCAAACCCCAT TAATTCTCCCTCTAGGGTTTTCAAACCAAACCCTCTCTTCTTTTATATCTTCCACTTCTTCTAAGGCTTTCTGTGAAATATCTTCTTATCTTTCTTTGAGAACATGAAAGAAGCTGCCTTTAGCCAATACTCTTTCATTGTTCTTTTTGTCTTTAGATGTATGTATTCTGGGTTTCTTCTCTTTGCATTTTCTTTCTAACATATATATCTATACATATTCTGAGCTTTTTAGGGCTTACGTCATGTTGTGATTTTTGAATAGTTGCAAGCCTTTTTAAACCCTTTGTATTGAGTTGATTTTTATGTCTCTTTTTTTCTTCAAGAAATTAAAATAAAAAGGGCTGTGATCTATATGTGTGACTTGATTTCTATTTTTTTTAATTTAAAAGTACAAAATATAAAAAGGGTTGAGATTTATATATGGGTGAGATGATTTCTATCTCTTTTTTAATTTTAAAAATAAAAATATAAAAAGGGTGGAGATTTATATATGTGTGTGAGGTGTTGTGGTTGAAACCAGTGGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAAGATAGTGCTGCTGGCTTATGGATTCCTCAAGTCCTATCTTTATGGTTTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATAACCCAGGAGCTTTATTACCTTACTTTATGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCCTCTATTATTTCTATCCAAACCCCATGAAGAAAACTCTCATAATTAATACCCTATCTAAGATTTTCTTTTATATATATATATATAAAGAATCCATCTTTCAG 3 0 3' arm Centaurea_solstitialis mirnest MIR159 9.0E-10 vvi-MIR159c 5.0E-11 -77.2 .(((.(((....(((..((((..((((((.((((((((((((..(((((((.((((((((.(((((((..(((((.(((.((((.(((((....((.((((.(((((...((......)).))))).)))).))....))))).)))).))).)))))..)))))))...)))))))).)))))))..))))))))))))....)))))).))))...))).))).))) (-77.2)