mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCA GAGTCAGCGGTTTATCGATC TGTGCGTTTGGTGGAGTTCATTGGAGTCAGCGGTTTATCGATCAGTTCCTTTTAACAAACGCATGAACAAGAGAGAGCGAGCGTAAAAGAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTCCACCCCTGCCTTATT GAAGAGAAAAAACGAAGGGCGATCAAACGTACGTTAATGGCGGACTACAATTCTTCTGGTTCGTCCATTTCTTCTCTACGCAATTAACTATCACTTTATTATAGCTTTACAGTGATTTACGATCACGATCGACCGATATATATATATACACATACGTATTTGTACTTTTGTACCTGTATTTTTATACATCAAAATCCGTTAAAGAAAAGTTGCAGATCTGGATTTTTCTTAGGTTTTAATCTTCAATATGTTATCTGTTGTTTGATTCGTTTCGATAAAGTGTTTGTTATCTGTTGATTGAAATTGTGTGTAATTTGTGCGTTTGGTGGAGTTCATTGGAGTCAGCGGTTTATCGATCAGTTCCTTTTAACAAACGCATGAACAAGAGAGAGCGAGCGTAAAAGAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTCCACCCCTGCCTTATTTATCATCATCATTCTGTAGGTAATAATCGTTTTTTGTTTCCGATTGTTTCATTGATTTCGTTCTTCTTCTTGTTGGTTTTTTTTTCTCTTGTGAATGAATTTTGTGAACTTTTAAGTTTGGAAGAAATTTGTAGATTGTGACAAATTTGAAGGTGGAATATTTGATTAAGTTTGTTATATAATCAATTGATAAATGAAATTTTGTCTCTGAGTTTAATTGTAATGATACAGATGGAATTTGGTTTAAAG 3 0 3' arm Centaurea_solstitialis mirnest MIR162_2 0.000000008 osa-MIR162a 0.0000000004 -51.8 ...(((...((((((...(((((((..(((.((((((((((((.(((((((((.....((((.((............)).))))..))))))))).)))))))))))).)))..)))))))))))))..)))...... (-51.8)