mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTCATCATCATCATCGTCA ACTATGGTTGTTGGAGAAT TCTTCCTCAATTTCCAGATTTATTTCATCATCATCATCGTCATCATCGTTATGTATACTGCTAATCTTCTAGGTTTTGGTCTTGCCGTCTCTTCCAGTGCATTCATCGGATCAAGCTTCATCATTAAAAAGAAAGGTCTCCAAAGGGCTGGTGCTTCTGGTACTCGTGCCAGCTCAGGAGGATATGGTTATCTGCTAGAGCCACTGTGGTGGATTGGCATGTTGACTATGGTTGTTGGAGAATTTGCGAATTTTGTAGCTT GGCGGGGGATCGATTGGATTCATTGGATGACAATAGACGACCTAATTGCCACAATTCCACTTTCTCAATAACAATAATTTTCAGATGAAACTTTCATCTCTCAACTGCTGCTGTTCTTCTTCCTCAATTTCCAGATTTATTTCATCATCATCATCGTCATCATCGTTATGTATACTGCTAATCTTCTAGGTTTTGGTCTTGCCGTCTCTTCCAGTGCATTCATCGGATCAAGCTTCATCATTAAAAAGAAAGGTCTCCAAAGGGCTGGTGCTTCTGGTACTCGTGCCAGCTCAGGAGGATATGGTTATCTGCTAGAGCCACTGTGGTGGATTGGCATGTTGACTATGGTTGTTGGAGAATTTGCGAATTTTGTAGCTTACATCTATGCTCCGGCTGTGCTTGTGACTCCCCTTGGAGCATTGAGTATTATTGTAAGTGCGGTTCTAGCACATTTCTTACTGAACGAGAAATTGCGGAGAATGGGAATACTAGGTTGTGTGCTTTGTATAGTGGGTTCCACCATCATAGTGCTTCATGCCCCTGGTGAACATAGCATAAGCTCTGTGGAAGAGATTTGGGACTTGGCAACACAACCAGCTTTTCTTTTGTATACAGCTTCAGCAATAGCTGTGGTCCTGGCATTGGTGTTGTACTGTGAACCACGCTATGGGCAGAGTAATATGATGGTGTATATTGGCGTATGTTCGATAAATGGTTCATTGACGGTTATGAGCGTCAAAGCAATAGGTATCGCCATAAAACTTACATTAGAGGGTTCAAGCCAGGTGGCACGCTACCAAACCTGGATTTTTGTAATGGTAGCTGTTACATGTATTATCACTCAATTGAATTACTTAAACAAGGCCTTGGATACATTTAACA 4 2 5' arm Centaurea_solstitialis mirnest 100 100 -63.1 .....(((((.((((((((((..((((.((..(((((.((((.((.............(((((((((.((((((((((((...(((((.((((((.(((....))).(((((...(((..........)))...))))).....((((((((((...........)))))))))).)))))).))))).....)))))))))....))).))))))))))).)))).))))))).))))))))))).)))..))).))... (-63.1)