mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGAAGATAGAGAGCACTAAG TCGTGCTCTCTATACTTCTGTC GAGTACGCGGGCAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAAAACCAATTCAAAAGAGAGAGAGAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCAT AGAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGGCAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAAAACCAATTCAAAAGAGAGAGAGAGAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTATTTCTTCTTCTTTCTTACCTATACACACATATACATTCACACTTATGCATCAATACTTAAATTACGTACATAGGTTCATGCATCTCACATATACTAATTAGGTGATTTCTTTTTTTTGTTAGTGAGCACTTACTTTCTTGTCATTACTTAAGCCCAGTTAAAGATTTGTTTTCCTTGTAAATTTGATCCATCATATCGCGACATATGTCTCACTGGTGTAACTGCAGCAGTTGCGGACAACCAAACTTTCTTGTAGTTTCTTTGGCAGGGGTTGCAAGAAGTTTCAGTGACAATCACAGTGACTCTGTTAAACATGATTTTCTCAACCATTTAAATGTCGATCGATCTCTGGATTCAACCAACATAAATCAATACCCGAACAGCAGAATATGTAACCTAACCAAACCGACCATGAAAATTTACAAAGTTACAGGTACAAAAATTCAGTTAAGAAAAAAAAAAACAGAACTTAATACATCAATTGTCAATATAGACATTAAAATTAGATAATTTCTAATATAAATTAAAATTTTATATAATTTAATAATTTAGGGTTAAATGAAAATTTAAAATAAATTTTTGTTATATATATTA 1 1 5' arm Brassica_napus mirnest 100 bna-MIR156b 4e-54 -50 .........(((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((...(((...(((((((((.(((.....)))))))).))))...))).......(((............))).)).))))))))...))))).))))))))))).))))))))........ (-50)