mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCTCTCCGTCTCAAAAT TTTGAGACGGAGTGAGTATTA TTAAACTTTTGATACTCTCTCCGTCTCAAAATTATTGTCAGGAGACAAAAATCATCCAGTTTAATAAAAGTAAGACCACTACAATTTTTAACCATTCAAATGTAATATTCCCTCACTTTATTCTATTTTTATTACTTAATGTGGAAAGTGGAGAATTAATTTGAGATATCCTAATAAGGAAATGTGGACCATTATTTTGAGACGGAGTGAGTATTATATTTTAT GGCACAATGGGGACTGACTTTTGATTTAGCAGTTGCTGTACATGTTTAAGAAGATCATACTTGAACCTTTAGCTTTACCCCTATCTAATGTTAGTTTTTATATTCATGATTTTCTCATATATGATCTGACCCACTTTTTACTAAAAAATTACCGTACAGTGATCAACTCCCCGCCGCAACGCGGCGGTCGTCGCCCACCTCGTTTTGTTTATTTAGCCGTTGAAACTTGAAGGATAGATATGTTACTCTTTTTAAACTTTTGATACTCTCTCCGTCTCAAAATTATTGTCAGGAGACAAAAATCATCCAGTTTAATAAAAGTAAGACCACTACAATTTTTAACCATTCAAATGTAATATTCCCTCACTTTATTCTATTTTTATTACTTAATGTGGAAAGTGGAGAATTAATTTGAGATATCCTAATAAGGAAATGTGGACCATTATTTTGAGACGGAGTGAGTATTATATTTTATTGATGATTTGTTAAGAGGGAACTTATGCTTACATAGGGGTGTGCATCGGGCCGGAACCCGACCCGTCCCG 1 0 5' arm Artemisia_annua mirnest MIR1122 0.0008 100 -51.4 .........((((((((.((((((((((((((.((.(((.(((...........))).(((....(((((((.......)))..)))).)))..(((((((.....((((..((((((...(((((..(((.....))).))))))))))).))))..)))))))((.((((....)))).))...))).)).)))))))))))))).))))))))........ (-51.4)