mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACGAACATGAAACTGATTT ATCATTTATGCTTATTATT AAATCCCACACAACTTAACCTTAACGAACATGAAACTGATTTACAAAACAAATTTTAATAAAATATTATTCATAAAAATTTTAACTGTCACACATGCACCACCTTTTGGATGTATAATGCATTTCTTACGTGCGTGATCATTTATGCTTATTATTGGCCGTAGCTTGAGTGTC CAAATATTGAATTTCACGAACCCTACTTAAAAAGTAAACAACTTTTTCCATGTAACTTGCAACTTATAATAAGTAGAACACAAGTTGCTAAACATGAAAATTAAAATGTTTAAATCCCACACAACTTAACCTTAACGAACATGAAACTGATTTACAAAACAAATTTTAATAAAATATTATTCATAAAAATTTTAACTGTCACACATGCACCACCTTTTGGATGTATAATGCATTTCTTACGTGCGTGATCATTTATGCTTATTATTGGCCGTAGCTTGAGTGTCCACCACCATGAGCACCACCCGCACCACCACCTTTATGACCATGTCCTTCACCGCCGCCGTGACCGTATGGAGCGGCTGCTGGTACCAAGATTGGTTTCTTCTTTCTCTTAGCTAAGCAGAAGAGACCGGCAGCTAAGAATGCTAAGAAGAACACACCACCAAGTGATGCACACACTGCAATGACAACAGTGTGGTCATGTCCACCACCACCAGAAGGTGGTGGTGTTAGGATGTTACCGGATGGGGGAACTGCATTGTAAGGTTGTG 3 2 5' arm Artemisia_annua mirnest 100 100 -22.6 ......(((.(((.(((.((.(((.((.((((((..(((((.(((....(((((((.((.((......)).)).)))))))....))).....((((((((.....))).))))).((((((.......))))))))))))))))).)).)))..))...))).))).))).. (-22.6)