mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGCACCTGCACCTGCACCA CTGCGGGTGCGGGTTCGGGTT ATAAACCACCACCTGCACCTGCACCTGCACCAGTTCAAGATTCAGGTTTAAGGGGCAGTGAGGAAGGTAGGGTTGGTGTTACACCGTCTTCGGTACCGGTTTCTGGTGTGAATCCTGCGGGTGCGGGTTCGGGTTCTGCGCAG CTTCATCATCATCATCATTTGTTATAAAAATCCCATCATATGAAGAAGTAATAAACAACTCACAATCCAAACCCACATCACAATCTCTATTCAACCCATCTCAATCCTTCACTCAAGCTTTCAATTCCATCAAAAACACTGAATTTTATAAACCACCACCTGCACCTGCACCTGCACCAGTTCAAGATTCAGGTTTAAGGGGCAGTGAGGAAGGTAGGGTTGGTGTTACACCGTCTTCGGTACCGGTTTCTGGTGTGAATCCTGCGGGTGCGGGTTCGGGTTCTGCGCAGAATCGGAATGCGATACTTGTTAGTAATAGGCAGAAAGGAAATCCTTTGCTAAAACATATAAGAAATGTGAGATGGGCTTTTGCAGATATTGTCTGTGACTATATGCTGGGGAAAAATTCATGTGCTCTTTATCTAAGTCTTAGGTATCATCTACTTCACCCGGACTATCTATATTACCGAATAAGAGAATTGGGAAAAGACTTTAAGCTTCGCGTTGTGTTATGTCATGTTGATGTTGAAGATGTTGTCAAGCCATTGTTAGAAGTCACAAGGACGGCTCTTCTTCATGACTGCACTCTTTTGTGTGGTTGGAGCTTGGAAGAATGTGGTCGGTATTTGGAGACTATAAAAGTTTATGAAAACAAGCCCGCAGACCTCATTCAAGGCCAAATGGATACAGACTATTTAT 4 0 5' arm Artemisia_annua mirnest MIR530 0.0005 ptc-MIR530a 0.00003 -49.8 ..........(((((.(((((((((((((...(((((....(((((.....((.((...(((((.(((..............))).))))).)).))....)))))..)))))..))))))))))))).)))))......... (-49.8)