mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTCCGTCCCAAAAT TTTTGGACGGAGGGAGTGCGA TTAATATGTAAAATAATTCTTCTCAAAATTTTATTATAACTAGTGCATATTCCTTGTAACATACTCCCTCCGTCCCAAAATTTAAGTTCAGTTTGACTTTTTTTAATCCAACTTTGACCTTAAATAGTTTCGGTTGTGTTATATAATATTTGATGCAAAATATATAAATGGATTGGATTTTAAATATATTTTCATATGATATAATTTTCATCAAGTATTATGTAATAAAAGCAAAAATATTTATGGTCAAAGTTAGATTCAAAAAGTCAAACTGGACTTAAATTTTTGGACGGAGGGAGTGCGAGATATGACTGATTAATAAATACGAATGGCTTAAGTGTGAAGAATAATTAAAATGTGA GAAAGTATATCAAAGTCCGTCTATAGAAAGATAAATAAATACTCGTCATGATGGTGTAATTATTGTCGCTTAACGATTAACGGTTTAAGAGATATTTAAATTATAAAACATAGGTGAAATATTAAAATACTTTTAATCTCAGACACTGGTTTTTATATAGATGAAGAGTGGGGATGAGTCCCTTGGTATGTGATAAAAGTTTAATATGTAAAATAATTCTTCTCAAAATTTTATTATAACTAGTGCATATTCCTTGTAACATACTCCCTCCGTCCCAAAATTTAAGTTCAGTTTGACTTTTTTTAATCCAACTTTGACCTTAAATAGTTTCGGTTGTGTTATATAATATTTGATGCAAAATATATAAATGGATTGGATTTTAAATATATTTTCATATGATATAATTTTCATCAAGTATTATGTAATAAAAGCAAAAATATTTATGGTCAAAGTTAGATTCAAAAAGTCAAACTGGACTTAAATTTTTGGACGGAGGGAGTGCGAGATATGACTGATTAATAAATACGAATGGCTTAAGTGTGAAGAATAATTAAAATGTGAAGGGTGAAAAGTAATTGTAGCCACACATTTTAAATTGGAAGGAAATTGAAAGAAGATGCATTCACTTTTGTATGTGCATTTGAAATTTGTGATTGCGA 3 0 5' arm Artemisia_annua mirnest MIR1122 0.00009 tae-MIR1122 0.00008 -118.6 ...........(((.(((((((.((....(((((((....((((.(((((..(((((.....(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((..((((.((((((((((.((((((.(((..(((.(((((((((((((((((((.(((.(((((..(((((.((.(((...))).))..)))))...))))).))).)))))))))))))))))))..))).))).)))))).)))))))))).)))).)))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))..)))))))...............)).))))))).)))......... (-118.6)