mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAATCCTGATGATGCTGCAGC TGCTTAATAATTGATGATTCAG GGGTGAGTCAAATATTGAATCTTTGATGTGGGAATCCTGATGATGCTGCAGCACTCTTAGCATAGATTTGGTGTAGAAGAGGTCCATTGCTATTAACATTGTTTTCATATGAAGCTACAGACAAATCAGTTACTCCTTCCATTGTGCTGCTTAATAATTGATGATTCAGTGAGTTGAAGTTCGGTGGATCCATCACA GAAACAAGACTAATTCATTTAACACATAAATGTTAAATAACCTACTTGAGTACATGGCCGGGTTTCTTCACATTCATTTCTTGGTTGATGCTTTATGAACGAGAACCTAACAACTCGATGGTGTAGTTAACAGATATACACAAAATTGTTTCACTACTTAAAGATCAAGAAACGTTAGCCAACTATGGAATAACACATTTTTTTTTATCACCATCGTTCGATTCTATATATCCATAAAACATAACCTTGGTCTTCACAACTCATACAAAATGAAAAGACCAACTACTTGCTTAGCATATATACTTCCAATCCATAAACAAAACTATGATCACCTTAACTAGTGTATGCATTTCTTCTCTTTTTTGTTGTTTTCTAGGAGGTGGATATATGATGATTCATAAGAAAGTTAAGTTATACCATGTACGACCAAATTTGTGCAGCATTTATGGGATGGTGGTGGGGTGAGTCAAATATTGAATCTTTGATGTGGGAATCCTGATGATGCTGCAGCACTCTTAGCATAGATTTGGTGTAGAAGAGGTCCATTGCTATTAACATTGTTTTCATATGAAGCTACAGACAAATCAGTTACTCCTTCCATTGTGCTGCTTAATAATTGATGATTCAGTGAGTTGAAGTTCGGTGGATCCATCACATGATGTATAGACGGGTCACCATGTCTCATAAAATGCTTGTATCCGTGTACTTCATGGTGATTTGTATATGACTCGGGAACTGTATGGCTAAGAAATTGTGATGATGTTGCCTCACTTATTAATCCCGTGTTCCTAAATCCAAGCTGGATCGAGTCAGAATGACGATCCTTAACAAAACGACCAT 5 1 5' arm Artemisia_annua mirnest mir-172 0.00000005 vvi-MIR172c 0.000000003 -41.5 ..((((......(((((((.(((((((....(((((.((((.((...(((((((.......((.((...((.((((..((.(((....(((.....................)))....)))...))..)))).)).)).)).)))))))...)).))))..))))).....))))))))))))))......)))). (-41.5)