mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCCTCCGTCCCAATTT ATTGGGACGGAGGGAGTACAT TCCAAAATAATACTCCCTCCGTCCCAATTTATTTGTCCACTTTTGACTTTTGAAGTCTTTCTTTTACAACTTTGACCTCAAATATTCTTTTGTGTGTTGTATAATACTTTATGCAAAATATATAAATTGATTGAGTTTTAAATGTATTTTCATTGGGTATAACTTCCATCAAGTATTATATAACATAAACAACACAATTTAAGGTCAAAGTTGAGAAAGAAAGACTTCAAAAGTCAAAAGTAGACAAATAAATTGGGACGGAGGGAGTACATCATAGG GGATTTTTCTTGATTTTTTTTTGCATACATTCTTACCATACCATCCAAAATAATACTCCCTCCGTCCCAATTTATTTGTCCACTTTTGACTTTTGAAGTCTTTCTTTTACAACTTTGACCTCAAATATTCTTTTGTGTGTTGTATAATACTTTATGCAAAATATATAAATTGATTGAGTTTTAAATGTATTTTCATTGGGTATAACTTCCATCAAGTATTATATAACATAAACAACACAATTTAAGGTCAAAGTTGAGAAAGAAAGACTTCAAAAGTCAAAAGTAGACAAATAAATTGGGACGGAGGGAGTACATCATAGGGGCCTCGGTTCTCCCCTTACACTTGAACTTTTACATAACTTTACAATTACTATTCTAATGACTCGAATTAAGATAATTGAAAAACTTTGAGTACTTTTAAAATATTTAGCACATATGGCGGTAATAATGTTGTTCTTCCCCATTACTTTATTACACTAGTACTTTACCCATGAGTCTCAATCGTCCCAAAACAATATGTACAAGGATATGACTCGACTTAGCAACCATGTAATTGATTAGATAATTAACAAAGGGTTTAACAAATTTTGTCACAATAATGCACTAAAGGTGAGTGCATACAAGGTAGGCTAAGGCGATTTGGGTGTACATTTAAGTGGGGTGTAACAAATTCTCACTTTGAGTAAGATGCTCAAAGATCGAAACGAAAAGATAGGCTC 1 0 5' arm Artemisia_annua mirnest MIR1122 0.00007 100 -123.7 ..........(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((.........(((((((((((((((((.(((.((((((((((((((.....)))))...))))))))))))((((.......))))..))))))))))))))))).........)))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))......... (-123.7)