mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATGTACCCATA ACCTACTCAGAGTACATACTTCTTTATGTACCCATATGAACATACAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTTTGGTAGG 1 1 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-1 2e-32 mdo-mir-1 2e-42 -35.24 .((((((.(((((((((((((((((((((..(((((..............))))).))))))))))))))))))))).)))))) (-35.24)