mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA CGGGGTTGGTTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGGTGTGGAGTCTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAAAAATAACCCC 3 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-9 6e-24 mml-mir-9-1 7e-45 -40.3 .(((((((....(((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..)))...))))))) (-40.30)