mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCATCCGTCCCATAAT TATGTGACGGAGGTAGTACGA TGGATGACAAAATACTCCATCCGTCCCATAATAATTGTTCACTTTAACTTTTTTGAGTCTGTCTTGTTAAACTTTGACCACTAATATTTTTATTTGTGTTATATAATACTAGATAAACATTATACCAAATTAAAATGCATTTAAAACCCAATCTATTCATATATTTTTAATCAAGTATTATATCACACAAATAAAAATATTTATAGTCAAAGTTGAATACAAAAGACTAAAAAAAGTCAAAGTGGACAATTATTATGTGACGGAGGTAGTACGATATAA AGAAAAATAATTGAACTATGTTACATCCACAAAAGAACTAAAAAAAATAATCTAAAAAATGCAATGATATGTTTTAATTTGGTTAATCAAAAAGAAAAGAACGAAATTATTTGAAAAGCTACCAATCAAAACATTTTATTTAGCATAGCTCAAAATAATTTTAAGGGCCCGTTTGGTTTGTTGATAGGGATGATAATGAGTATCGGATTTGGTATGCTGTAGAATGACAATGGATATAAACAAGTGTATGATTACGATTGTTTATGTTTGGATGACAAAATACTCCATCCGTCCCATAATAATTGTTCACTTTAACTTTTTTGAGTCTGTCTTGTTAAACTTTGACCACTAATATTTTTATTTGTGTTATATAATACTAGATAAACATTATACCAAATTAAAATGCATTTAAAACCCAATCTATTCATATATTTTTAATCAAGTATTATATCACACAAATAAAAATATTTATAGTCAAAGTTGAATACAAAAGACTAAAAAAAGTCAAAGTGGACAATTATTATGTGACGGAGGTAGTACGATATAAGAAAATGTATAGATATTTGAGTATTGTAGTGAAAACAAAAAAGGGCCACAAATAGACACCAAATTAATGTGTAATGAATCTATGAATATGATATACTGTGGTATTTTTGGACCCACTAAACAAGAAAAAAAACAAACGGATAAAATCCACGACA 2 2 5' arm Artemisia_annua mirnest MIR1122 0.0003 osa-MIR1442 0.0002 -90.234 ((.....))...((((((.((((((.(((((((((((((((((((.((((((((.(((((...((((..(((((((((....(((((((((((((((((.((((((((((.(((.((...((((...................................))))...)).))).)))))))))).)))))))))))))))))....)))))))))....)))).))))).)))))))).))))))))))))))))))).)))))))).))))........ (-90.234)