mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGC AAGCCCTTACCCCAAAAAGTA GATCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTTCCTCTCAACAGTAGTCAGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGTATCT 4 0 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-129 1e-33 eca-mir-129a 7e-35 -29 ((((((((((.(((..((((((.(((..(..((....))..).))).))))))..))).))))))).))). (-29.00)