mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTG GCTGGTAAAATGGAACCAAATC GGAGCCAAATGCTTTGCTAGAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCGACTGTCCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTGTGCATTGATGGCGCCG 5 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-133 1e-28 mml-mir-133c 1e-52 -47.5 ((.(((((((((...((((.(((((((..((.((.((((((((.(........).)))))))).)).))..))))))).))))...)))))..)))).)). (-47.50)