mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAGTGTTTCCTACTTTATGGA CATAAAGTAGAAAGCACTACTAA GACAGTGCAGTCACCCATAAAGTAGAAAGCACTACTAACAGCACTGGAGGGTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGATGAGTGTACTGT 3 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-142 7e-42 mml-mir-142 1e-43 -44 .((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).)))))))) (-44.00)