mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTATAGATGATGTACTAG GGGATATCATCATATACTGTAAG TGGGGCCCTGGCTGGGATATCATCATATACTGTAAGTTTGCGATGAGACACTACAGTATAGATGATGTACTAGTCCGGGCACCCTC 1 1 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-144 3e-35 hsa-mir-144 2e-42 -44.8 .(((((((.((((((.((((((((.(((((((((.((((......))))..))))))))))))))))).)))))).)))).))).. (-44.80)