mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGTAATCCGAGCACTTTGG AGAGTGCTGGGATGACAGGTG ACCCAGTTAATTTTTCACCATGTCAGCCAGGCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTGCCAGAGTGCTGGGATGACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCGTGTTCCCATTTTTTATTTCCATGCTGCTTTCATCTTCATTTCCCAGTTCTTTCTTTTGATTACCTACTTTTAAAAACTGTCGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCGAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCTAATCACGGGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGGTGAAACCCTGTCT ACACAGTAGCGTAGCCCCACAAGTTACGTGAGCATCGCTACCACTGTGGGAGACCATGCATCCACCCGCGATCCTGACTGCATAGCTCGTCTCTCAGACGGAGGCGCCAGCACCCTCCCCGTGGCTGTTTCTTCAATACCTCCATTTTCCTTTCTTTGGAATTGCCCTTCTGGCATTCCCTTTTTGTTTTCGTTTTTCTTTTTTGGGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACAGCAACTTCCAGCTCCTGGGTTTAAGCGATTCCCCTTAAGCGATTCTCCTGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCACACCACCACACCCAGTTAATTTTTCACCATGTCAGCCAGGCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTGCCAGAGTGCTGGGATGACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCGTGTTCCCATTTTTTATTTCCATGCTGCTTTCATCTTCATTTCCCAGTTCTTTCTTTTGATTACCTACTTTTAAAAACTGTCGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCGAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCTAATCACGGGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAAATTAGGCCGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTCCTCGGGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGCAAGACTCCTTCCC 2 0 3' arm Artemisia_annua mirnest Metazoa_SRP 6e-27 hsa-mir-3929 0.0000000003 -147.5 ............(((((((..((.((((((((((.(((((((((((..(((((..((((((((((((((.((((((((((.((((.((((((((((((((((.((((((((((......((.((((((..............(((........................)))...........)))))).)).)))))))))).)))))))))))))))).)))).)))))))))).))))))))))))))..)))))))))))))))).))).......))))))).)))))))))........ (-147.5)