mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTAGTTTCATGTTGTTGGG ACAACAACATTAAACCACCCGAT TGAATTAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGCCTGGGTTTCTGAACACAACAACATTAAACCACCCGATTCAC 5 1 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-196 1e-27 mml-mir-196a-1 1e-33 -23.6 (((((..(((.((((.((((((((((..(.........)..).))))))))).)))).)))..))))). (-23.60)