mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGTAGTCTGCACATTGGTTA CCCAGTGTTTAGACTATCTGTTC CCAGAGGACACCTCCACTCCGTCTACCCAGTGTTTAGACTATCTGTTCAGGACTCCCAAATTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTGGGCTGGGTTAGACCCTCG 2 1 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-199 2e-49 hsa-mir-199b 3e-57 -42.9 ...((((.....((((..(((((((.(((((((.(((((((.((((.((((....))....)).))))))))))).))))))).))))).))..))))......)))). (-42.90)