mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCT AGTTGAGTCTGGACGTCCCG CGCCCCGGGCCGCGGCTCCTGATTGTCCAAACGCAATTCTCGAGTCTATGGCTCCGGCTGAGAGTTGAGTCTGGACGTCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCTCGAGCGG 3 1 5' arm Pan_troglodytes mirbase mir-219 8e-27 ptr-mir-219-1 1e-56 -49.7 (((.(.((((.(((((((..(((.(((((.((.((((((((.((((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).)))).........).))). (-49.70)