mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTACATTGTCTGCTGGGTTTC ACCTGGCATACAATGTAGATTTCTGT TGAACATCCAGGTCTGGGGCATGAACCTGGCATACAATGTAGATTTCTGTGTTCGTTAGGCAACAGCTACATTGTCTGCTGGGTTTCAGGCTACCTGGAAACATGTTCT 3 5 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-221 8e-27 mml-mir-221 3e-57 -47.2 .((((((((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))....))))). (-47.20)