mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGGGTTGGGTGGAGGCTCTCC AGGGCCCCCCCTCAATCCTGTTG AGGACCCTTCCGGAGGGCCCCCCCTCAATCCTGTTGTGCCTAATTCAGAGGGTTGGGTGGAGGCTCTCCTGAAGGGCTC 2 1 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-296 3e-19 ppy-mir-296 5e-27 -44.1 .(..((((((.((((((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).)))))))).))))))..) (-44.10)