mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCGCCTCGACGACAGAGCC CCCTGTCCTCCAGGAGCTCACG CGGGGCGGCCGCTCTCCCTGTCCTCCAGGAGCTCACGTGTGCCTGCCTGTGAGCGCCTCGACGACAGAGCCAGCGCCTGCCCCAGTGTCTGCG 6 0 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-339 8e-42 hsa-mir-339 2e-45 -48.7 .(((((((.((((..(.(((((.((.(((.(((((((.((....)).))))))).))).)).))))).)..)))).))))))).......... (-48.70)