mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTTGGGGGCAGATGT CCGCAGGGAAAATGAGGGACTTTTGGGGGCAGATGTGTTTCCATTCCACTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCA 4 1 3' arm Pan_troglodytes mirbase mir-365 4e-40 cfa-mir-365-1 1e-43 -35.4 ..((((((..((((((((..(((((((((((((((((.........))).)))....))))))))))).))))))))..)))))). (-35.40)